基本操作の大筋は

・十字キーによる移動
・メインショット癖や隙の少ない基本攻撃・サブウェポン扱いの要点を押えると強力な補助攻撃)
・ディスチャージ(メインショット力を放出する事による強力な攻撃手段)

の1レバー3ボタン構成です。
これにポーズ等の直接ゲームに関与しない補助3ボタンを加え、
合計6ボタンを使います。
※拡張操作用にそれ以上割り当てる事も出来ます

(基本操作の簡易一覧)
必須機能ボタン 補助機能ボタン
入力キー作戦中の操作メインメニュー画面中の操作
十字キー移動上下で項目選択・左右でEXECUTOR選択
メインショット癖や隙の少ない基本攻撃項目の決定
サブウェポン扱いの要点を押えると強力な補助攻撃(項目が作戦の場合)リプレイ再生選択メニューへ
ディスチャージSOLを放出する事による強力な攻撃手段(項目が作戦の場合)ボス戦モード
ポーズ一時中断画面に移行(ポーズ)EXECUTORのタイプ選択(装備表示欄が緑色の場合のみ)
中断1秒間押し続けると強制終了しメインメニューに戻る(項目が作戦の場合)ボス戦リプレイ再生選択メニューへ
リトライ1秒間押し続けるとやり直す(SEGMENT LOCATIONのみ)(リプレイ再生中の場合)押している間リプレイを早回し

同梱のHS_padas.exeを実行する事で、各ボタンの機能割り当てを変更できます。
現在割り当てる事が出来る機能は  ・メインショット  ・サブウェポン  ・ディスチャージ  ・ポーズ  ・中断  ・リトライ  ・拡張操作:低速移動制御 の7種類です。 キーボード上での対応は 1 Z 2 X 3 C 4 V 5 ESC 6 F10 となります。